营养习惯可能通过外周炎症途径（如微生物区系）通过小胶质细胞作用而影响神经退行性疾病的发生和进展。已知营养素和代谢物能调节免疫系统。

然而，饮食诱导效应的机制尚不清楚。例如，外周炎症和肠道微生物失调可以调节神经炎症，增加神经变性的发生率。

地中海国家的传统饮食模式的特点是水果、蔬菜和全麦食物摄入量高；鱼类、家禽和酒精（特别是红酒）摄入量适中；以橄榄油为主要脂肪来源。而西方发达国家更普遍的西方化饮食与患慢性炎症性疾病的风险增加有关。地中海饮食导致微生物代谢物（短链脂肪酸[SCFAs]）、Prevotella细菌和其他Firmicutes的水平增加。

西方饮食的特点是蛋白质含量高（来源于加工肉类）、饱和脂肪、精制谷物、糖和盐增加、酒精增加，而且大多是玉米果糖糖浆，水果和蔬菜消费减少。西式饮食的饮食成分增加了皮质醇的释放，影响了对压力的反应。西方饮食已被证明对肠道微生物区系有影响，导致细菌总数减少，以及特定物种，如双歧杆菌和布氏杆菌。

已经确定了肠道微生物影响小胶质细胞的几种双向信号通路，包括免疫和神经通路。